使用凝膠色譜系統的一些注意事項：

　　溶劑準備：使用HPLC純溶劑，如有必要，進行過濾。溶劑的相溶性，避免使用對不銹鋼有腐蝕性的溶劑。

　　溶劑脫氣：聲脫氣。

　　樣品準備：過濾樣品，確保樣品中不含固體顆粒，用流動相溶解樣品。

　　色譜柱的保護：

　　(1)防止氣體進入色譜柱。凝膠柱是不允許氣泡進入的，否則將會使柱效降低甚至形成微小的難以驅除的氣室。因此，為了防止氣泡進入色譜柱，一定要使用經過脫氣的流動相，并且要嚴格按照下列步驟來安裝色譜柱：

　　a.拆卸下色譜柱入口處的密封螺絲，觀察是否有溶劑滲出；

　　b.如有溶劑滲出，即可將色譜柱接到管路上，以避免氣泡的進入；

　　c.如無溶劑滲出時，表明色譜柱的此端已經進去空氣了，此時，可將色譜柱的出口端接到進樣閥上，以流動相來反方向沖洗色譜柱，以便將柱內的空氣排除。以0.2ml/min的小流量來沖色譜柱，如果溶劑的流速太快或者是壓力突然的上升都將會導致柱性能的降低；

　　d.如果流出的溶劑里不含有氣泡，說明柱內的氣體已經被排出了，再將色譜柱以正確的方向接好，這樣氣泡就進不到色譜柱里面了。

　　(2)色譜柱的清洗。為了不使被測物質和雜質停留在色譜柱中，在每次的樣品分析工作完成之后，都應及時地清洗色譜柱。首要用對被測樣品洗脫能力的溶劑來洗脫色譜柱，以分析工作中常用的反相色譜分析法為例，因其流出的物質是性大的物質，此時應用100%的甲醇或使用異丙純、四氫呋喃等性稍弱的溶劑將吸附在柱內的性小的物質洗脫下來，洗脫液的用量一般為柱體積的20倍即可。如果流動相是緩沖溶液，則應用蒸餾水來沖洗色譜柱，以沖掉柱內的鹽，然后再用合適的溶劑來沖洗。

　　凝膠濾過色譜法(Gel Filtration Chromatography)中所使用的凝膠柱常用緩沖溶液做流動相，用完之后當然要用蒸餾水來沖洗。如果是連續操作，可以將緩沖溶液置于柱內過夜，但是維持小流速(＜0.5ml/min)以防止緩沖鹽的析出，如果流動相中含有鹵化物，即使是停一夜，也必須要用蒸餾水將色譜柱沖洗干凈，以防止它們對柱體的腐蝕。

　　(3)色譜柱的存放。如果色譜柱暫時不用，存放時要注意以下幾點：

　　a.幾天之內的短期放置，凝膠柱則用蒸餾水來沖洗，再把色譜柱的兩頭用密封螺絲密封好即可。

　　b.如果色譜柱長期不用，僅用上述方法來處理就不行了，這時應使用色譜柱使用說明書中所指明的溶劑來充滿色譜柱，凝膠柱則不能用水了，因柱內如果有微生物的生長則會使柱效降低，此時應用0.05%的NaNs水溶液(防腐劑)來沖洗色譜柱，再將色譜柱封嚴。色譜柱長期放置時，一定要將色譜柱的兩端封嚴，以防止由于溶劑揮發而造成的柱填料干縮現象，因這可導致柱效的嚴重降低。

　　c.色譜柱應貯存在室溫下，如果放置于0℃以下的環境里，柱內就會結冰，這也將導致柱效的降低。

　　(4)不要溫使用。

　　(5)不要壓沖洗柱子

　　對儀器的維護和保養進行記錄。